所謂所得稅“匯算清繳”，是指所得稅的納稅人以會計數據為基礎，將財務會計處理與稅收法律法規(guī)規(guī)定不一致的地方按照稅收法律法規(guī)的規(guī)定進行納稅調整，將會計所得調整為應納稅所得，套用適用稅率計算得出年度應納稅額，與年度內已預繳稅額相比較后的差額，確定應補或應退稅款，并在在稅法規(guī)定的申報期內向稅務機關提交會計決算報表和企業(yè)所得稅年度納稅申報表以及稅務機關要求報送的其他資料，經稅務機關審核后，辦理結清稅款手續(xù)。企業(yè)所得稅匯算清繳工作應以企業(yè)會計核算為基礎，以稅收法規(guī)為依據。

企業(yè)所得稅的匯算清繳，由納稅人自行計算年度應納稅所得額和應繳所得稅額，根據預繳稅款情況，計算全年應繳、應退稅額，并填寫納稅申報表，在稅法規(guī)定的申報期內向稅務機關進行年度納稅申報，也可以委托社會中介機構代理申報，經稅務機關受理并審核后，辦理結算稅款手續(xù)。之后，稅務機關根據選案標準、平時及審核中掌握的情況，有針對性地進行納稅檢（稽）查。

根據現行所得稅法的規(guī)定，凡財務會計制度健全、帳目清楚，成本資料、收入憑證、費用憑證齊全，核算規(guī)范，能正確計算應納稅所得額，經稅務機關認定適用查帳征收的企業(yè)，均應當在年終進行所得稅的匯算清繳。其適用對象具體包括：

（1）實行獨立經濟核算，依法繳納企業(yè)所得稅的內資企業(yè)或者組織，包括國有企業(yè)、集體企業(yè)、私營企業(yè)、聯(lián)營企業(yè)、股份制企業(yè)及有生產、經營所得和其他所得的組織。

（2）外商投資企業(yè)和外國企業(yè)。包括在中國境內設立的中外合資經營企業(yè)、中外合作經營企業(yè)和外資企業(yè)，以及在中國境內設立機構、場所，從事生產、經營和雖未設立機構、場所，而有來源于中國境內所得的外國公司、企業(yè)和其他經濟組織。

（3）個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)投資者個人所得稅。包括依法登記成立的個人獨資企業(yè)、合伙企業(yè)，獨資、合伙性質的私營企業(yè)，合伙制律師事務所，及經政府有關部門依照法律法規(guī)批準成立的負無限責任和無限連帶責任的其他個人獨資、個人合伙性質的機構或組織。

納稅人納稅年度內無論盈利、虧損、或處于減免稅期，均應按照相關稅法的規(guī)定辦理年度企業(yè)所得稅的納稅申報

根據《企業(yè)所得稅暫行條例》及其實施細則，《中華人民共和國稅收征收管理法》及《國家稅務總局關于企業(yè)所得稅匯算清繳管理辦法》（1998-10-20國稅函[1998]182號）等法律的規(guī)定，內資企業(yè)所得稅的匯算清繳應按以下程序進行：

內資企業(yè)繳納所得稅，按年計算，分月或者分季預繳。

納稅人應當在月份或者季度終了后十五日內，向其所在地主管稅務機關報送會計報表和預繳所得稅申報表；年度終了后四十五日內，向其所在地主管稅務機關報送會計決算報表和所得稅申報表，在年度終了后四個月內結清應補繳的稅款。預繳稅款超過應繳稅款的，主管稅務機關予以及時辦理退稅，或者抵繳下一年度應繳納的稅款。

應注意的是：

（1）實行按月或按季預繳所得稅的納稅人，其納稅年度最后一個預繳期的稅款應于年度終了后15日內申報和預繳，不得推延至匯算清繳時一并繳納。

（2）若納稅人已按規(guī)定預繳稅款，因特殊原因不能在規(guī)定期限辦理年度企業(yè)所得稅申報的，則應在申報期限內提出書面延期申請，經主管稅務機關核準后，在核準的期限內辦理。

（3）若納稅人因不可抗力而不能按期辦理納稅申報的，可以延期辦理；但是，應當在不可抗力情形消除后立即向主管稅務機關報告。主管稅務機關經查明事實后，予以核準。

（4）納稅人在納稅年度中間破產或終止生產經營活動的，應自停止生產經營活動之日起30日內向主管稅務機關辦理企業(yè)所得稅申報，60日內辦理企業(yè)所得稅匯算清繳，并依法計算清算期間的企業(yè)所得稅，結清應繳稅款。

（5）納稅人在納稅年度中間發(fā)生合并、分立的，依據稅收法規(guī)的規(guī)定合并、分立后其納稅人地位發(fā)生變化的，應在辦理變更稅務登記之前辦理企業(yè)所得稅申報，及時進行匯算清繳，并結清稅款；其納稅人的地位不變的，納稅年度可以連續(xù)計算。

（一）采用“應付稅款法”

1.計算出應繳或應補繳的所得稅時：

借：所得稅

貸：應交稅金——應交所得稅

2.實際上繳稅款時：

借：應交稅金——應交所得稅

貸：銀行存款

3.實際收到退回的多繳稅款時，作與上述方向相反的會計分錄。

（二）采用“納稅影響會計法”

1.計算出應繳的所得稅時，需減去（或加上）本期發(fā)生的遞延稅款：

借：所得稅

遞延稅款

貸：應交稅金——應交所得稅（或貸：遞延稅款）

2.實際上繳稅款時

借：應交稅金——應交所得稅

貸：銀行存款