事業(yè)單位獎金稅是為了鼓勵事業(yè)單位向經濟自主、經費自給過渡，使事業(yè)單位有計劃地逐步提高職工收入水平，并從宏觀上控制消費資金的過快增長而制定的一種稅收制度。

國務院1985年9月20日發(fā)布《事業(yè)單位獎金稅暫行規(guī)定》，規(guī)定事業(yè)單位超過國家規(guī)定工資標準，多發(fā)的工資和發(fā)放的獎金，包括用取得的經濟收入開支的各種獎金性質的工資、津貼、補貼和實物獎勵等，均需繳納事業(yè)單位獎金稅。1994年廢止。

包括從事教育、衛(wèi)生、科研、文藝、體育、新聞、出版、通訊、廣播、電視、農林、水利、氣象、海洋、水產、畜牧、地質勘探、地震、測繪、規(guī)劃、商檢、物資儲備、社會福利、環(huán)保、環(huán)衛(wèi)、公路養(yǎng)護、園林綠化、市政建設、房地產管理等各類事業(yè)單位。

(1)凡實行企業(yè)化管理的事、№單位，國家不再核撥事業(yè)經費，經上級主管部門和財政部門批準，按照國家和省、自治區(qū)、直轄市規(guī)定的工資標準和核定的增資指標自費工資改革的，在增發(fā)工資外，全年發(fā)放獎金總額人均不超過三個半月基本工資金額的，免稅，全年發(fā)放獎金總額人均超過二個半月至四個半月基本工資的部分，稅率為20％，超過四個半月至五個半月基本工資的部分，稅率為50％，超過五個半月至六個半月基本工資的部分，稅率為100％，超過六個半月基本工資的部分，稅率為200％。

(2)凡需要國家核撥一部分事業(yè)經費的事業(yè)單位，按照國家和省、自治區(qū)、直轄市規(guī)定的工資標準和核定的增資指標自費工資改革的，在增發(fā)工資外，全年發(fā)放獎金總額人均不超過兩個半月基本工資金額的，免稅，全年發(fā)放獎金總額人均超過兩個半月至三個半月基本工資的部分，稅率為20％，超過三個半月至四個半月基本工資的部分，稅率為50％，超過四個半月至五個半月基本工資的部分，稅率為100％，超過五個半月基本工資的部分，稅率為200％。

(3)部分自費、部分依靠國家撥款進行工資改革的事業(yè)單位，在增發(fā)工資外，全年發(fā)放獎金總額人均不超過兩個月基本工資金額的，免稅；全年發(fā)放獎金總額人均超過兩個月至三個月基本工資的部分，稅率為20％，超過三個月至四個月基本工資的部分i稅率為50％，超過四個月至五個月基本工資的部分，稅率為100％，超過五個月基本工資的部分。稅率為200％。

(4)凡需國家核撥全部事業(yè)經費，并完全用國家核撥經費進行工資改革的事業(yè)單位，全年發(fā)放獎金總額人均超過核定限額的，超額部分比照國營企業(yè)獎金稅適用稅率征收獎金稅。

事業(yè)單位獎金稅的計稅依據為事業(yè)單位發(fā)放的各種形式的獎金，包括從各種資金渠道發(fā)放的各種獎金和實物獎勵，以及超過國家規(guī)定標準多發(fā)的各種獎金性質的工資、津貼、補貼、酬金(含收入分成)等。

按國家規(guī)定經批準發(fā)放的各種津貼以及副食品補貼、價格補貼等，不計征獎金稅。

納稅人違反財務制度規(guī)定，將獎金(包括獎金性質的工資、津貼、補貼、酬金、實物獎勵等)在費用和其他專用基金中列支的，除按違反財經紀律處理外，還應計入獎金總額征收獎金稅。

事業(yè)單位經上級主管部門和財政部門批準，按照國家和省、自治區(qū)、直轄市規(guī)定的工資標準和核定增資指標進行工資改革所增發(fā)的工資不計入獎金總額。

事業(yè)單位獎金稅的計算公式為：

應納獎金稅額=全年發(fā)放獎金總額×適用稅率×速算扣除系數×月基本工資總額

事業(yè)單位在年度內發(fā)放獎金超過免稅限額后，應先納稅，后發(fā)獎金。