所謂應稅所得率是指對核定征收企業(yè)所得稅的企業(yè)計算其應納稅所得額（不是應納所得稅額）時所確定的比例，是企業(yè)應納稅的所得額占其應稅收入的比例。該比例根據各個行業(yè)的實際銷售利潤率或者經營利潤率等實際情況分別測算得出，而不是稅率。應稅所得率的作用主要是用于確定納稅人的應納稅所得額，從而計算出納稅人最終應繳納的企業(yè)所得稅。

企業(yè)所得稅的稅率是指納稅人的應納的企業(yè)所得稅稅額占應納稅所得額的比例。調整應稅所得率后，實行按應稅所得率方法核定征收企業(yè)所得稅的納稅人，仍應按照稅法規(guī)定的稅率計算應繳納的所得稅額。個別媒體對政策誤讀主要原因是混淆了“應稅所得率”和“企業(yè)所得稅稅率”兩個基本概念。

雖然調低應稅所得率的最終結果也會使企業(yè)實際少繳所得稅，但與降低稅率的性質完全不同：調低應稅所得率是為了客觀反映企業(yè)的實際經營效益情況，準確計算企業(yè)應繳納的所得稅，其所反映的是在不改變稅率的前提下，由于企業(yè)盈利下降而少繳的所得稅；而如果是調低所得稅率，則是在企業(yè)盈利情況不變的前提下，由于稅率降低而少繳的所得稅，因此絕不能把兩者等同起來。

就是應納稅所得額與銷售收入的比率，而所得稅負擔率就是應納所得稅額與銷售收入的比率。

應稅所得率是對核定征收企業(yè)所得稅的企業(yè)計算其應納稅所得額（不是應納所得稅額）時預先規(guī)定的比例，是企業(yè)應納稅的所得額占其經營收入的比例。該比例根據各個行業(yè)的實際銷售利潤率或者經營利潤率等情況分別測算得出。它不是稅率。

國家稅務總局制定的《核定征收企業(yè)所得稅暫行辦法》（國稅發(fā)〔2000〕38號）規(guī)定，按核定征收方式征收企業(yè)所得稅的企業(yè)，在收入總額或成本費用支出額能夠正確核算的情況下，可按應稅所得率計算應納稅所得額，再計算出應納稅額，據以申報納稅。

以上清楚地說明，應稅所得率不是稅率。企業(yè)所得稅稅率是稅法規(guī)定的企業(yè)應納所得稅額占其應納稅所得額的比例?！镀髽I(yè)所得稅暫行條例》和有關政策規(guī)定，不管是查賬征收企業(yè)還是核定征收企業(yè)，企業(yè)所得稅的稅率均為33％，但對應納稅所得額在3萬元（含 3萬元）以下的企業(yè)，暫減按18％的稅率征收所得稅；對應納稅所得額在10萬元（含10萬元）以下至3萬元的企業(yè)，暫減按27％的稅率征收所得稅。所以，將應稅所得率等同于稅率的看法是錯誤的。

根據國家稅務總局關于印發(fā)《企業(yè)所得稅核定征收辦法》（試行）的通知（國稅發(fā)[2008]30號）規(guī)定，納稅人具有下列情形之一的，核定征收企業(yè)所得稅：（一）依照法律、行政法規(guī)的規(guī)定可以不設置賬簿的；（二）依照法律、行政法規(guī)的規(guī)定應當設置但未設置賬薄的；（三）擅自銷毀賬簿或者拒不提供納稅資料的；（四）雖設置賬簿，但賬目混亂或者成本資料、收入憑證、費用憑證殘缺不全，難以查賬的；（五）發(fā)生納稅義務，未按照規(guī)定的期限辦理納稅申報，經稅務機關責令限期申報，逾期仍不申報的（六）申報的計稅依據明顯偏低，又無正當理由的。

特殊行業(yè)、特殊類型的納稅人和一定規(guī)模以上的納稅人不適用本辦法。上述特定納稅人由國家稅務總局另行明確。

因此，核定應稅所得率的內資企業(yè)年終匯算清繳，是不能按與查賬征收的企業(yè)同樣方法進行年終匯算清繳的。

根據國家稅務總局關于印發(fā)《企業(yè)所得稅核定征收辦法》（試行）的通知（國稅發(fā)[2008]30號）及國家稅務總局關于印發(fā)《中華人民共和國企業(yè)所得稅月（季）度預繳納稅申報表》等報表的通知（國稅函[2008]44號）文附件：2.中華人民共和國企業(yè)所得稅月（季）度預繳納稅申報表（B類）的規(guī)定，核定應稅所得率的內資企業(yè)年終匯算清繳應視其根據何種情形（收入總額、成本費用總額、經費支出總額）核定的其應稅所得率，匯繳方式是不同的。您的第2、3種理解是正確的。

如果是按收入總額核定的其應稅所得率，那么年終匯算時，首先匯算本年度全年累計取得的各項收入金額，按稅務機關核定的應稅所得率計算全年應納稅所得額；再按《企業(yè)所得稅法》規(guī)定的適用率計算全年應納所得稅額，減享受減免稅優(yōu)惠過渡期的稅收優(yōu)惠、小型微利企業(yè)優(yōu)惠、高新技術企業(yè)優(yōu)惠及經稅務機關審批或備案的其他減免稅優(yōu)惠的當期實際享受的減免所得稅額，再減當年累計已預繳的企業(yè)所得稅額，最終計算出本年度匯算應補（退）所得稅額。