行政事業(yè)財務管理體制是指財政部門同行政事業(yè)主管部門之間、行政事業(yè)主管部門同所屬行政事業(yè)單位之間關于財政資金的分配使用、領撥繳銷的方法、形式以及責任、權力與利益劃分的基本組織制度，包括行政事業(yè)單位預算管理級次、預算管理辦法兩項基本內容。它貫穿于行政事業(yè)財務管理全過程，是財政管理體制的重要組成部分。

行政事業(yè)財務管理體制的主要內容：

(1)行政事業(yè)單位的分級，原則上實行三級管理，即分為主管單位、所屬單位和基層單位三級管理。

(2)行政事業(yè)單位財務管理辦法主要有三種，即全額預算管理、差額預算管理和企業(yè)化管理三種形式。

財務管理體制確定的合理與否，直接關系到財政預算收支平衡和事業(yè)計劃，行政任務的完成。確定合理的財務管理體制，一般應遵循以下幾項原則：

第一，“統(tǒng)一領導，分級管理”的原則。實行統(tǒng)一領導，是社會主義公有制和市場經濟的客觀要求，是社會主義制度基本特性的重要體現(xiàn)；同時，由于中國幅員遼闊、人口眾多，各地區(qū)經濟文化發(fā)展水平、自然條件和風俗習慣差別很大，為了發(fā)揮中央、地方兩個積極性，有必要在堅持統(tǒng)一領導的前提下，實行分級管理。由于行政事業(yè)財務管理具有門類繁多，情況復雜的特點，各個部門和單位又有自己的經濟利益，因此，在確立行政事業(yè)財務管理體制時，更要很好地貫徹這項原則。

第二，事權與財權相適應的原則。事權，是指國家賦予各級行政事業(yè)主管部門和單位從事各項工作和業(yè)務活動的責任和權力；財權，是指各級行政事業(yè)主管部門和單位根據國家財政，財務制度規(guī)定，對本部門、本單位各項資金的分配使用權。賦予部門和單位財權的目的，是為了調動部門和單位合理安排使用資金的積極性，保證工作任務和事業(yè)計劃的完成。因此，在確定行政事業(yè)財務管理體制時，對財權范圍和財力大小的劃分，必須注意和事權與任務相適應，做到財權與事權相統(tǒng)一。

第三，責、權，利相結合的原則。責，權、利，對于行政事業(yè)主管部門和單位來說，都是一種客觀存在。在工作中，一是要正確認識，尊重這種客觀存在；二是要貫徹好“三兼顧”的原則，有多大的權力，就應有多大的責任，并有相應的利益。

第四，實事求是，區(qū)別對待的原則。在確定行政事業(yè)財務管理體制時，必須根據不同類型單位的特點和具體情況，采取不同的財務管理形式和財務管理辦法，切忌搞“一刀切”。