合并納稅是指大型企業(yè)集團的母子公司實施盈虧相抵之后的收益繳納所得稅，實施兩稅合并新企業(yè)所得稅法確立了法人稅制的原則，具有法人資格的企業(yè)都必須單獨納稅，財稅〔2008〕119號通知要求，為確保新稅法的平穩(wěn)實施，根據(jù)新稅法第五十二條規(guī)定，以前實行合并繳納企業(yè)所得稅的企業(yè)集團，在2008年度繼續(xù)按原規(guī)定執(zhí)行，從2009年1月1日起，上述企業(yè)集團一律停止執(zhí)行合并繳納企業(yè)所得稅政策。

1.合并繳納

《國家稅務總局所得稅管理司關(guān)于合并繳納企業(yè)所得稅政策執(zhí)行問題的函》(所便函〔2008〕27號)明確說明，《企業(yè)所得稅法》第52條規(guī)定：“除國務院另有規(guī)定外，企業(yè)之間不得合并繳納企業(yè)所得稅”。在國務院對企業(yè)合并繳納企業(yè)所得稅政策尚未做出規(guī)定前，原經(jīng)國家稅務局批準實行合并繳納企業(yè)所得稅的企業(yè)，暫按原規(guī)定繼續(xù)執(zhí)行。

《財政部、國家稅務總局關(guān)于試點企業(yè)集團繳納企業(yè)所得稅有關(guān)問題的通知》(財稅〔2008〕 119號)規(guī)定，為確?！镀髽I(yè)所得稅法》的平穩(wěn)實施，根據(jù)新稅法第五十二條規(guī)定，經(jīng)國務院批準，對2007年12月31日前經(jīng)國務院批準或按國務院規(guī)定條件批準實行合并繳納企業(yè)所得稅的企業(yè)集團(具體名單見附件)，在2008年度繼續(xù)按原規(guī)定執(zhí)行。從2009年1月1日起，上述企業(yè)集團一律停止執(zhí)行合并繳納企業(yè)所得稅政策。

根據(jù)上述規(guī)定，目前，可以實行集團內(nèi)合并繳納企業(yè)所得稅的企業(yè)僅限于上述名單范圍內(nèi)的企業(yè)，其他企業(yè)一律不得自行合并繳納企業(yè)所得稅。在該名單上有包括中國五礦集團、中糧集團、中化集團等106家集團企業(yè)。

2.匯總繳納

《國家稅務總局關(guān)于印發(fā)〈跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理暫行辦法〉的通知》(國稅發(fā)〔2008〕28號)第二條規(guī)定，居民企業(yè)在中國境內(nèi)跨地區(qū)(指跨省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市，下同)設立不具有法人資格的營業(yè)機構(gòu)、場所(以下稱分支機構(gòu))的，該居民企業(yè)為匯總納稅企業(yè)(以下稱企業(yè))，除另有規(guī)定外，適用本辦法。

因而，對于實行匯總繳納方式的企業(yè)是指在同一法人主體下，在境內(nèi)跨地區(qū)設立了不具有法人資格的機構(gòu)或者場所的情況下，需要按照國稅發(fā)〔2008〕28號文件相關(guān)規(guī)定進行匯總繳納。

第三條規(guī)定，企業(yè)實行“統(tǒng)一計算、分級管理、就地預繳、匯總清算、財政調(diào)庫”的企業(yè)所得稅征收管理辦法。

第四條規(guī)定，統(tǒng)一計算，是指企業(yè)總機構(gòu)統(tǒng)一計算包括企業(yè)所屬各個不具有法人資格的營業(yè)機構(gòu)、場所在內(nèi)的全部應納稅所得額、應納稅額。

第六條規(guī)定，就地預繳，是指總機構(gòu)、分支機構(gòu)應按本辦法的規(guī)定，分月或分季分別向所在地主管稅務機關(guān)申報預繳企業(yè)所得稅。

第七條規(guī)定，匯總清算，是指在年度終了后，總機構(gòu)負責進行企業(yè)所得稅的年度匯算清繳，統(tǒng)一計算企業(yè)的年度應納所得稅額，抵減總機構(gòu)、分支機構(gòu)當年已就地分期預繳的企業(yè)所得稅款后，多退少補稅款。

因而，對于總分機構(gòu)的匯總繳納是按同一法人主體進行統(tǒng)一計算企業(yè)所得稅，只是在季度時分支機構(gòu)需要按照國稅發(fā)〔2008〕28號文件中相關(guān)規(guī)定在所在地進行預繳企業(yè)所得稅，但這部分預繳的企業(yè)所得稅可以在年終與總機構(gòu)統(tǒng)一匯算時抵減總機構(gòu)應繳企業(yè)所得稅。

根據(jù)以上規(guī)定，簡單理解就是匯總繳納適用于總、分企業(yè)之間納稅；合并繳納適用于母子公司之間納稅。只要是總、分支企業(yè)關(guān)系，可直接按《跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理暫行辦法》規(guī)定，實行"統(tǒng)一計算、分級管理、就地預繳、匯總清算、財政調(diào)庫"的企業(yè)所得稅征收管理辦法計算繳納稅款。而母子公司之間實現(xiàn)合并納稅，必須經(jīng)國務院批準，執(zhí)行“統(tǒng)一計算、分級管理、就地預交、集中清算”的匯總納稅辦法計算繳納稅款。

目前總機構(gòu)在年終匯算清繳企業(yè)所得稅時，其利潤總額并不是單個分支機構(gòu)利潤總額簡單相加，而是總、分企業(yè)會計報告的并表。也可以理解扣減掉內(nèi)部抵消利潤后確定。就是將整個企業(yè)視為一個企業(yè)核算。