自理報關(guān)是指進出口貨物收發(fā)貨人自行辦理報關(guān)業(yè)務(wù)，收發(fā)貨人必須向海關(guān)注冊登記后方能辦理報關(guān)業(yè)務(wù)。

自理報關(guān)企業(yè)進行網(wǎng)上錄入、申報、查詢、打印報關(guān)單，以及網(wǎng)上查詢海關(guān)回執(zhí)等操作。

1、自理報關(guān)單位錄入業(yè)務(wù)流程：

(1)自理報關(guān)單位持“報關(guān)單錄入”權(quán)操作員卡的操作員進入中國電子口岸“報關(guān)單錄入”界面，可先下載本企業(yè)征免稅證明、加工貿(mào)易手冊或加工區(qū)備案清單后，脫機錄入報關(guān)單數(shù)據(jù)(數(shù)據(jù)暫存在本地數(shù)據(jù)庫)；

(2)錄入并提交后將錄入的報關(guān)單數(shù)據(jù)信息上載到數(shù)據(jù)中心，進入自理報關(guān)審核申報業(yè)務(wù)流程；

2、自理報關(guān)審核申報業(yè)務(wù)流程：

自理報關(guān)單位持“報關(guān)單審核申報”權(quán)操作員卡的操作員進入中國電子口岸的“報關(guān)單審核申報”界面，對報關(guān)單的邏輯性、填報的規(guī)范性進行審核，確保報關(guān)單可以向海關(guān)進行申報。若審核不通過，則需要將報關(guān)單下載本地進行修改，修改后的報關(guān)單需重新上載到數(shù)據(jù)中心，并且需要重新進行審核。審核通過后進入自理報關(guān)申報確認業(yè)務(wù)流程；

3、自理報關(guān)申報確認業(yè)務(wù)流程：

(1)自理報關(guān)單位持“報關(guān)單申報確認”權(quán)操作員卡的企業(yè)管理人員進入中國電子口岸“報關(guān)單申報確認”界面，對報關(guān)單進行確認申報操作，經(jīng)“申報確認”后的報關(guān)單通過公共數(shù)據(jù)中心傳海關(guān)內(nèi)部網(wǎng)。如果申報確認時認為報關(guān)單的填制不符合邏輯，需要將報關(guān)單數(shù)據(jù)下載到本地進行修改，修改完畢之后需要將數(shù)據(jù)重新上載到數(shù)據(jù)中心，并且重新進行審核和申報確認。

(2)自理報關(guān)單位打印出經(jīng)海關(guān)審核通過的報關(guān)單，并攜帶其他單證去海關(guān)辦理其他通關(guān)手續(xù)。

1、客戶對象的不同。

自理報關(guān)是從事處理企業(yè)本身的報關(guān)業(yè)務(wù)的，因而報關(guān)業(yè)務(wù)的客戶(服務(wù)對象)固定，報關(guān)員只從事本身企業(yè)的報關(guān)業(yè)務(wù)。而報關(guān)行報關(guān)員則是面對廣大有報關(guān)需求的企業(yè)，服務(wù)客戶面廣。

2、業(yè)務(wù)范圍的不同。

自理報關(guān)業(yè)務(wù)只從事與本企業(yè)有關(guān)的報關(guān)業(yè)務(wù)，企業(yè)的業(yè)務(wù)范圍決定了企業(yè)報關(guān)員的報關(guān)業(yè)務(wù)范圍。受企業(yè)的業(yè)務(wù)限制，從事企業(yè)報關(guān)的報關(guān)員一般只需懂得有關(guān)本企業(yè)的報關(guān)業(yè)務(wù)就可以了。而報關(guān)行報關(guān)員由于面對的是所有企業(yè)的報關(guān)業(yè)務(wù)，因此，報關(guān)的業(yè)務(wù)各種各樣，有機會接觸較全面的報關(guān)業(yè)務(wù)。

3、收入來源不同。

自理報關(guān)的企業(yè)報關(guān)員一般拿企業(yè)的工資，多屬于固定工資方式，某時期業(yè)務(wù)量的多與少與工資沒有聯(lián)系。而報關(guān)行報關(guān)員一般是按報關(guān)量的提成計算工資的，薪水與報關(guān)業(yè)務(wù)量直接關(guān)系。