部門內(nèi)部審計機(jī)構(gòu)是指縣級以上各級政府的各部門，根據(jù)審計業(yè)務(wù)需要而建立的在部門負(fù)責(zé)人領(lǐng)導(dǎo)下的專職審計機(jī)構(gòu)，它負(fù)責(zé)對本部門及所屬單位的財務(wù)收支和經(jīng)濟(jì)效益進(jìn)行審計，審計業(yè)務(wù)受同級政府審計機(jī)關(guān)指導(dǎo)，向本部門負(fù)責(zé)人和同級政府審計機(jī)關(guān)報告工作。

部門內(nèi)部審計機(jī)構(gòu)的設(shè)置有兩種形式，一種是完全由本單位設(shè)置機(jī)構(gòu)和人員；另一種是在一些主管部門中，由國家審計機(jī)關(guān)派駐，受國家審計機(jī)關(guān)與本部門的雙重領(lǐng)導(dǎo)。但是，不論部門內(nèi)部審計機(jī)構(gòu)的設(shè)置采取哪種形式，—般都有以下特點(diǎn)：它的審計業(yè)務(wù)要受與本部門同級的國家審計機(jī)關(guān)的領(lǐng)導(dǎo)，向本部門及其同級的國家審汁機(jī)關(guān)報告工作；它對下屬單位行使與國家審計機(jī)關(guān)相同的監(jiān)督職權(quán)，它根據(jù)本行業(yè)生產(chǎn)、技術(shù)、經(jīng)營的特點(diǎn)，有條件組織行業(yè)性的審計活動，它對本行業(yè)的所屬單位(或重點(diǎn)企業(yè))的內(nèi)部審計工作進(jìn)行組織、指導(dǎo)和檢查。