部門內(nèi)部審計機構是指縣級以上各級政府的各部門，根據(jù)審計業(yè)務需要而建立的在部門負責人領導下的專職審計機構，它負責對本部門及所屬單位的財務收支和經(jīng)濟效益進行審計，審計業(yè)務受同級政府審計機關指導，向本部門負責人和同級政府審計機關報告工作。

部門內(nèi)部審計機構的設置有兩種形式，一種是完全由本單位設置機構和人員；另一種是在一些主管部門中，由國家審計機關派駐，受國家審計機關與本部門的雙重領導。但是，不論部門內(nèi)部審計機構的設置采取哪種形式，—般都有以下特點：它的審計業(yè)務要受與本部門同級的國家審計機關的領導，向本部門及其同級的國家審汁機關報告工作；它對下屬單位行使與國家審計機關相同的監(jiān)督職權，它根據(jù)本行業(yè)生產(chǎn)、技術、經(jīng)營的特點，有條件組織行業(yè)性的審計活動，它對本行業(yè)的所屬單位(或重點企業(yè))的內(nèi)部審計工作進行組織、指導和檢查。