特種集裝箱是指為適應特種貨物運輸?shù)?a href="/wiki/%E9%9C%80%E8%A6%81" title="需要">需要，而在集裝箱的結構和設備方面進行了特殊設計和裝備的集裝箱。

因所適用的貨物種類不同，而有許多種類，其主要有以下幾種：

①開(敞)頂集裝箱(Open Top Container)。

這是一種沒有箱頂或頂部敞開的集裝箱，裝卸貨物時需使用起重機將重貨從頂部裝入箱內或卸出。將貨物裝入后，再用防水篷布遮蓋頂部，以防貨物受損。這種集裝箱適于裝載玻璃板、鋼鐵制品、膠合板、機械設備等超高貨物，利用側壁可以固定的重貨，以及難以從箱門進行裝卸而必須由箱頂進行裝卸作業(yè)的貨物。

②框(板)架集裝箱(Flat Rack Container)。

這是一種沒有箱頂和箱壁、箱端壁也可卸下，只留箱底和四角柱來承受貨載的集裝箱。如果將四角柱拆下，也可作平臺集裝箱使用。這種集裝箱主要用于不適用于裝入雜貨集裝箱或開頂集裝箱內的長大件、超重件、輕泡貨、重型機械、鋼材、鋼管、裸裝設備等，會產生集中負荷的重貨、超尺度貨物、不怕風雨襲擊的貨物，需要從箱頂或箱側面裝載的貨物，以及需要在箱內固定的貨物。

③散裝集裝箱(Solid Bulk Container)。

這是用以裝載大豆、大米、麥芽、面粉、飼料以及水泥、樹脂、硼砂、化工原料等散裝粉粒狀貨物的集裝箱。使用這種集裝箱可以節(jié)約數(shù)量可觀的包裝費用，并提高裝卸效率。

對一些需要植物檢疫的貨物，比如對于進口糧食，有的需要在港外錨地進行熏蒸消毒?？梢栽谏⒇浖b箱上設置投入熏蒸藥物的開口，以及熏蒸氣體排出口，并且可要求這種集裝箱在熏蒸時能保持完全氣密。

④罐狀集裝箱(Tank Container；Liquid Bulk Container)。

這是一種適用于裝載酒類、油類、化學品、危險品等液體貨物的集裝箱。這類集裝箱具有適用于裝載這類貨物的特殊結構和設備。裝貨時，貨物由罐頂部的裝貨孔進入；卸貨時，貨物由底部排出孔靠重力作用自行流出，或由頂部裝貨孑L吸出。

除了上述一些特種用途的集裝箱外，還有一些適用于各類更專門的特種集裝箱，如：專供運載汽車的汽車集裝箱，專供運輸活牲畜的動物集裝箱等。