專利合同糾紛主要是指在專利申請(qǐng)權(quán)轉(zhuǎn)讓或者專利權(quán)轉(zhuǎn)讓合同、專利技術(shù)實(shí)施許可合同、專利技術(shù)中介服務(wù)合同中各方當(dāng)事人就權(quán)利義務(wù)的履行和合同條款的解釋等方面發(fā)生的爭(zhēng)議。

專利合同糾紛主要有以下幾種。

1．專利申請(qǐng)權(quán)轉(zhuǎn)讓或者專利權(quán)轉(zhuǎn)讓合同糾紛

這類專利合同糾紛是在專利申請(qǐng)權(quán)轉(zhuǎn)讓或者專利權(quán)轉(zhuǎn)讓過程中發(fā)生的。引起這類糾紛的主要原因有以下幾個(gè)方面：①在專利申請(qǐng)權(quán)或者專利權(quán)存在爭(zhēng)議的情況下，與他人簽訂的有關(guān)權(quán)利轉(zhuǎn)讓的合同可能無效，從而給受讓人造成損失，引起糾紛。②沒有取得共同申請(qǐng)人或者共同專利權(quán)人的同意，單獨(dú)將權(quán)利轉(zhuǎn)讓引起的糾紛。③專利權(quán)已經(jīng)失效(自動(dòng)放棄或被撤銷或被宣告無效)，原專利權(quán)人沒有及時(shí)通知受讓人，從而引起糾紛。④由于雙方?jīng)]有履行合同義務(wù)而引起的糾紛。專利申請(qǐng)權(quán)或者專利權(quán)轉(zhuǎn)讓合同，屬技術(shù)轉(zhuǎn)讓合同的一種，對(duì)糾紛的解決可直接按照《合同法》中關(guān)于技術(shù)轉(zhuǎn)讓合同的規(guī)定處理。

2．專利實(shí)施許可合同糾紛

指在專利實(shí)施許可合同中因?qū)?quán)利、義務(wù)約定不明確產(chǎn)生的糾紛。專利實(shí)施許可合同也屬于技術(shù)轉(zhuǎn)讓合同，對(duì)有關(guān)糾紛的處理也應(yīng)按照《合同法》的規(guī)定處理。

3．專利技術(shù)中介合同糾紛

專利技術(shù)中介合同屬于技術(shù)服務(wù)合同的一種，它是專利代理機(jī)構(gòu)、信息咨詢機(jī)構(gòu)、技術(shù)市場(chǎng)及個(gè)人為傳遞技術(shù)情報(bào)信息，組織工業(yè)化、商品化生產(chǎn)，促使專利權(quán)人和實(shí)施單位訂立的一種合同。這種合同可以是專利供應(yīng)方和專利需求方與中介方共同簽訂，或由供、需雙方分別與中介方單獨(dú)簽訂。合同建立在供、需雙方對(duì)中介方絕對(duì)信任的基礎(chǔ)上，自愿通過中介機(jī)構(gòu)實(shí)施。中介服務(wù)合同糾紛是供、需雙方與中介方發(fā)生的糾紛，應(yīng)按技術(shù)服務(wù)合同來規(guī)范各自的權(quán)利義務(wù)及違約責(zé)任。

從我國(guó)《合同法》規(guī)定處理合同糾紛的方式看，主要有三種方式，一是調(diào)解，二是仲裁，三是訴訟。

1.調(diào)解

2.仲裁

仲裁是仲裁機(jī)構(gòu)對(duì)合同糾紛進(jìn)行審理和裁決的一種處理方法。合同糾紛的仲裁前提，必須是在合同中規(guī)定有明確清楚的仲裁條款，或者在產(chǎn)生糾紛后雙方達(dá)成進(jìn)行仲裁處理的協(xié)議。仲裁的決定對(duì)雙方都具有法律的拘束力，必須執(zhí)行，對(duì)不履行仲裁裁決的，另一方可申請(qǐng)人民法院強(qiáng)制執(zhí)行。

3.訴訟

訴訟是指專門的司法機(jī)關(guān)，即人民法院按照《民事訴訟法》的規(guī)定對(duì)合同糾紛進(jìn)行審理和裁決的一種處理方法。這也是目前使用最普遍的一種方法。對(duì)于專利合同糾紛，如果合同中未規(guī)定仲裁條款，糾紛發(fā)生后，又未達(dá)成仲裁協(xié)議，糾紛雙方均可依法向有管轄權(quán)的人民法院提起訴訟，人民法院按照訴訟程序?qū)＠贤m紛作出審理裁判。

由于調(diào)解并不發(fā)生法律效力，因此，國(guó)家并未專門設(shè)置調(diào)解合同糾紛的機(jī)構(gòu)?？梢姡幚砗贤m紛的機(jī)構(gòu)就只有進(jìn)行仲裁的仲裁機(jī)構(gòu)和進(jìn)行訴訟的人民法院。

最高人民法院《關(guān)于審理專利糾紛案件適用法律問題的若干規(guī)定》第1條列舉了16類專利糾紛。其中，第3項(xiàng)屬于《規(guī)定》的專利合同糾紛；第1、2、4、5、6、7、9屬于權(quán)屬、侵權(quán)糾紛，見《規(guī)定》第143條；第8項(xiàng)涉及臨時(shí)措施，見《規(guī)定》第339條和第340條；第10～15項(xiàng)屬于行政糾紛。

與專利申請(qǐng)權(quán)和專利權(quán)轉(zhuǎn)讓合同相關(guān)的規(guī)定是《專利法》第10條和《專利法實(shí)施細(xì)則》第14條，《合同法》第342條，最高人民法院《關(guān)于審理技術(shù)合同糾紛案件適用法律若干問題的解釋》第22～24條，最高人民法院《關(guān)于貫徹執(zhí)行<中華人民共和國(guó)民法通則>若干問題的意見(試行)》第137條。

與專利實(shí)施許可合同相關(guān)的規(guī)定是《專利法》第12條、第47條、第54條和《專利法實(shí)施細(xì)則》第15條，《合同法》第18章第3節(jié)，最高人民法院《關(guān)于審理技術(shù)合同糾紛案件適用法律若干問題的解釋》第3部分。

與專利代理合同相關(guān)的規(guī)定是《專利法》第19條和《專利代理?xiàng)l例》。