專用基金支出是指用專用基金收入安排的支出。如糧食風險基金支出等。

作為具有特定用途的資金，專用基金在管理與核算上必須遵循先收后支、量入為出的原則。

總預算會計設置“專用基金支出”科目，核算由專用基金收入所安排的支出，該科目按支出的項目設明細賬。發(fā)生專用基金支出時借記該科目，貸記“其它財政存款”科目；支出收回時借記“其它財政存款”科目，貸記該科目，平時本科目借方余額反映專用基金支出累計數(shù)；年終沖銷結轉時將該科目的余額如數(shù)轉入“專用基金結余”科目，借記該科目，貸記“專用基金結余”科目。年終結轉后本科目無余額。